29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7018 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7018  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  91.67 
 
 		 223 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  77.08 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  60 
 
 		 203 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  64.58 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  63.83 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  60.42 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  52 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  56 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  56 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  59.18 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  52.83 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  51.92 
 
 		 238 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  52 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  53.19 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  51.06 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  50 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  51.06 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  46 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  47.73 
 
 		 200 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  44.9 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.44 
 
 		 210 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  41.82 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  45.83 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>