28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2797 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  68.42 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  57.59 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  55 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  42.27 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  37.62 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  40.74 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  38.55 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  42.26 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  37.9 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  40.56 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  37.28 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  40 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  37.11 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  29.82 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  31.13 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  35.68 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  34.94 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  31.45 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  32.72 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  33.76 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  35.59 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2667  hypothetical protein  76.67 
 
 		 77 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  31.54 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>