25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4028 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  42.27 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  35.06 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  43.58 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  37.95 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  35.92 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  41.4 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  36.49 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  35.97 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  30.38 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  34.08 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  40.13 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  31.25 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  36.88 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  29.26 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  31.73 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  36.09 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  31.9 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  33.53 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  30.47 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  28.33 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  27.12 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  37.24 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  28.44 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>