12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4641 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  34.81 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  33.54 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  31.25 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  31.52 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  34.78 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  33.76 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  26.96 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  28.72 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  28.06 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  29.09 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  28.66 
 
 		 285 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>