23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1739 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 341 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  80.13 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  53.49 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  56.43 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  38.89 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  35.37 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  41.98 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  39.88 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  41.04 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  40.52 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  41.89 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  42.94 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  40.14 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  35.16 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  33.48 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  30.32 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  32.02 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  35.71 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  31.9 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  34.16 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  33.54 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  30.08 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>