17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4460 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  77.92 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  35.09 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  34.36 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  35.45 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  36.89 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  29.1 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  33.83 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  31.1 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  33.16 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  32.51 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  32.86 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  31.13 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  26.11 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  25.71 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  27.68 
 
 		 354 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>