25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1784 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  699    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  68.13 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  55.9 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  53.22 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  39.11 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  34.56 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  39.66 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  41.72 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  39.62 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  39.44 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  36.84 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  37.58 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  33.59 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  36.47 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  29.56 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  33.77 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  35.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  34.42 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  34.78 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  30.94 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  31.1 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  30.47 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0257299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>