19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1477 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  38.43 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  41.36 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  37.34 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  43.24 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  36.84 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  36.26 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  37.29 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  33.48 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  29.91 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  30.54 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  33.15 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  27.67 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  33.14 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  32.43 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  27.91 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  35.64 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>