18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3428 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  43.89 
 
 
318 aa  195  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  41.03 
 
 
303 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  46.51 
 
 
299 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  42.79 
 
 
326 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  36.19 
 
 
309 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  40.22 
 
 
336 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  36.89 
 
 
316 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  37.44 
 
 
341 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  38.27 
 
 
354 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  35.33 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  37.2 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  34.5 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  31.05 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  33.53 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  30.27 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  34.97 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  26.76 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>