26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  38.78 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  37.62 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  38.89 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  37.95 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  39.11 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  40.76 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  37.74 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  37.65 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  35.76 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  35.44 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  35.9 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  36.31 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  27.75 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  29.27 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  33.15 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  32.09 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  31.21 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  31.52 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  26.71 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  28.87 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  30.68 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>