17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4973 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  77.92 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  34.5 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  34.4 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  36.19 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  34.35 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  27.48 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  31.03 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  29.21 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  31.25 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  30.66 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  29.27 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  27.43 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  24.74 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  24.54 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  26.55 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>