21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1538 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  36.94 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  30.71 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  32.34 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  28.79 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  30.54 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  30.81 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  30.98 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  29.46 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  35.38 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  31.78 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  27.41 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  26.67 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  27.49 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  28.66 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  27.98 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  32.35 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>