19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2765 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  29.34 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  37.35 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  32.21 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  34.57 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  33.18 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  34.44 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  29.59 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  28.82 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  29.93 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  30.95 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  26.34 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  29 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  32.77 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  30.4 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>