15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3334 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  43.88 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  37.58 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  33.55 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  36.31 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  35.68 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  40.13 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  30.57 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  35.62 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  34.16 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  32.84 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  26.96 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  32.35 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>