25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1638 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  88.7 
 
 
274 aa  371  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0868  hypothetical protein  75.45 
 
 
141 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0872  hypothetical protein  89.62 
 
 
123 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1619  hypothetical protein  63.4 
 
 
275 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.631243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  38.98 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  37.93 
 
 
290 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  34.33 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  36.73 
 
 
349 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  42.45 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  36.97 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  36.97 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  41.11 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  28.18 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  25.12 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  25.5 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0781  hypothetical protein  28.7 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0308662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1756  hypothetical protein  37.36 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00985833  hitchhiker  0.000872746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  27.85 
 
 
212 aa  45.4  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3155  hypothetical protein  35.14 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18010  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000611728  normal  0.273057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  30.61 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  30.47 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>