273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4248 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4248  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 437 aa  878    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0369  protein serine/threonine phosphatase  76.07 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0013966  hitchhiker  0.00252542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2425  protein serine/threonine phosphatases  43.1 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167963  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3510  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 323 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4404  protein serine/threonine phosphatase  34.99 
 
 		 470 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4945  protein serine/threonine phosphatase  45.75 
 
 		 368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00525233  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2162  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3065  protein serine/threonine phosphatase  46.84 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0182  protein serine/threonine phosphatase  42.54 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4556  protein serine/threonine phosphatase  28.45 
 
 		 339 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.614538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  32.42 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  32.42 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  31.87 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  31.87 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  31.87 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  31.87 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  31.87 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  31.87 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  36.36 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  33.69 
 
 		 241 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  32.61 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  24.58 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  40.15 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  32.42 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  30.22 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  30.9 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.34 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.32 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  32.94 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  34.27 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.53 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  36.57 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.69 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  28.57 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  29.57 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  30.32 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.17 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  28.99 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  34.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  37.23 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  36.09 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  30.1 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0752  protein serine/threonine phosphatase  38.69 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  29.95 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1382  protein serine/threonine phosphatase  28.43 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.344903  hitchhiker  0.00931102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  27.33 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  28.78 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 		 244 aa  67  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.73 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  38.35 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  26.34 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  37.04 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.19 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  30.93 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.19 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  31.68 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.1 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  30.69 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  29.85 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3475  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  32.58 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  34.04 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  30.46 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  27.98 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.56 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.41 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.5 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  33.08 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  28.33 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  34.13 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  34.53 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  34.53 
 
 		 519 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  31.82 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0635  protein serine/threonine phosphatases  26.34 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000299869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  29.17 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  24.79 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>