272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4945 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4945  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
368 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00525233  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2425  protein serine/threonine phosphatases  48.31 
 
 
344 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167963  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0369  protein serine/threonine phosphatase  40.85 
 
 
511 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0013966  hitchhiker  0.00252542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4248  protein serine/threonine phosphatases  40.96 
 
 
437 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3510  protein serine/threonine phosphatase  37.57 
 
 
323 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4404  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2162  protein serine/threonine phosphatase  33.25 
 
 
428 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3065  protein serine/threonine phosphatase  49.68 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  37.22 
 
 
425 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  31.29 
 
 
249 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  25.9 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  28.32 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  25.74 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.05 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  41.09 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.9 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  24.92 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.52 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  24.75 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  25.08 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  24.75 
 
 
250 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  24.75 
 
 
250 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  24.92 
 
 
669 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  31.41 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.16 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  24.42 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  24.42 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  24.42 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  24.42 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  24.92 
 
 
669 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  24.83 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  24.11 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  26.76 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  32.37 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.06 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  37.24 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  29.54 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.91 
 
 
482 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  26.76 
 
 
236 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  27.4 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  34.24 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  35.91 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  31.52 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  29.94 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  23.63 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.53 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.46 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.12 
 
 
417 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  32.18 
 
 
467 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  30.1 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.11 
 
 
554 aa  66.2  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  27.89 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  27.18 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  31.22 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  34.46 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.56 
 
 
239 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  34.01 
 
 
519 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  31.25 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  31.89 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  32.45 
 
 
564 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  34.19 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  27.44 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  28.8 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 
241 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  31.61 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0752  protein serine/threonine phosphatase  26.57 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.07 
 
 
239 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  27.05 
 
 
270 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  33.9 
 
 
280 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 
267 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
239 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0342003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.65 
 
 
236 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  29.81 
 
 
558 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
280 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  27.4 
 
 
236 aa  62.8  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  25.42 
 
 
247 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 
239 aa  62.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  25.42 
 
 
247 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4570  protein serine/threonine phosphatase  26.77 
 
 
295 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0814124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  32.69 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  29.85 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3475  protein serine/threonine phosphatase  28.19 
 
 
781 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  32.72 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
567 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  26.57 
 
 
241 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  26.57 
 
 
246 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  30.06 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  32.09 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0788  Serine/threonine protein phosphatase  27.33 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>