More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3510 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3510  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
323 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0182  protein serine/threonine phosphatase  41.34 
 
 
413 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4404  protein serine/threonine phosphatase  46.62 
 
 
470 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0369  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0013966  hitchhiker  0.00252542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4248  protein serine/threonine phosphatases  35.48 
 
 
437 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3065  protein serine/threonine phosphatase  41.32 
 
 
393 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4556  protein serine/threonine phosphatase  36.14 
 
 
339 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.614538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4945  protein serine/threonine phosphatase  50.65 
 
 
368 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00525233  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2425  protein serine/threonine phosphatases  37.03 
 
 
344 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167963  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0752  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 
419 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2162  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
428 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.02 
 
 
305 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.82 
 
 
245 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  32.24 
 
 
246 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  32.53 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  31.72 
 
 
443 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  32.92 
 
 
425 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
597 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
463 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.12 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.29 
 
 
238 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  35.44 
 
 
505 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
280 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
416 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
477 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
394 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 
249 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  29.54 
 
 
239 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 
449 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  34.36 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.31 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.29 
 
 
236 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.31 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.97 
 
 
470 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
252 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  35.47 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  32.08 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  25.73 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  29.11 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  32.68 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  28.45 
 
 
236 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  25.73 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.05 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  31.65 
 
 
564 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  35.74 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.64 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  27.08 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.17 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.06 
 
 
558 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.43 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 
567 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  34.73 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  27.05 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  29.79 
 
 
574 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  30.45 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  29.63 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  30.49 
 
 
250 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  29.84 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  30.49 
 
 
250 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  30.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  30.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  30.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  30.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  28.87 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  35.83 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  28.87 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0788  Serine/threonine protein phosphatase  23.9 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  32.51 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  30.12 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  31.02 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.85 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  34.31 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.87 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  30.04 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.26 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0342003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>