272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0369 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0369  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
511 aa  1027    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0013966  hitchhiker  0.00252542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4248  protein serine/threonine phosphatases  76.07 
 
 
437 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2425  protein serine/threonine phosphatases  41.1 
 
 
344 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167963  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3510  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 
323 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4404  protein serine/threonine phosphatase  35.05 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4945  protein serine/threonine phosphatase  45.1 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00525233  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2162  protein serine/threonine phosphatase  31.11 
 
 
428 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3065  protein serine/threonine phosphatase  47.2 
 
 
393 aa  120  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0182  protein serine/threonine phosphatase  44.03 
 
 
413 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4556  protein serine/threonine phosphatase  35.9 
 
 
339 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.614538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.36 
 
 
395 aa  87  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  28.19 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  36.24 
 
 
249 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  35.53 
 
 
250 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  36 
 
 
250 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  28.12 
 
 
250 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  35.33 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.03 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  35.33 
 
 
250 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  32.97 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  26.74 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1382  protein serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.344903  hitchhiker  0.00931102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  32.95 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.53 
 
 
236 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.14 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.63 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  38.17 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  28.99 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  31.28 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  33.52 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  33.51 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  30.39 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0752  protein serine/threonine phosphatase  35.2 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.09 
 
 
243 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  30.73 
 
 
236 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  31.07 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  35.61 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  31.18 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  31.72 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  30.66 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.07 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  33.85 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  34.62 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.16 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.56 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.91 
 
 
305 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
394 aa  67  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  30.24 
 
 
435 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3475  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
781 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 
245 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 
443 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  31.22 
 
 
255 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  26.53 
 
 
252 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  30.04 
 
 
274 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  26.97 
 
 
241 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  37.69 
 
 
319 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  25.84 
 
 
256 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
259 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  33.08 
 
 
256 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 
479 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
259 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  33.85 
 
 
262 aa  64.3  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  36.76 
 
 
261 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  30.33 
 
 
267 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.33 
 
 
267 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  32.81 
 
 
291 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  34.56 
 
 
253 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  27.71 
 
 
276 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  32.35 
 
 
293 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  33.09 
 
 
252 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0402  protein serine/threonine phosphatase  25.67 
 
 
647 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  31.34 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1339  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
258 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172289  normal  0.468811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  29.65 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  30.81 
 
 
462 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4502  protein serine/threonine phosphatase  25.95 
 
 
753 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.492372  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
482 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  27.11 
 
 
247 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  27.11 
 
 
247 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  27.36 
 
 
236 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  33.72 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  27.71 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.46 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>