32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1908 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  281  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  49.61 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  47.06 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  52.94 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  39.36 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  50.79 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  35.24 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  43.28 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  43.16 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  33.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  39 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  32.74 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  30.97 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  34.17 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  35.63 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  36.79 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  36.54 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  31.73 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  39.02 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  34.04 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  34.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  39.74 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  36.14 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  35.9 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>