22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1836 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  57.83 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  57.83 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  58.23 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  56.96 
 
 		 145 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  56.96 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  46.74 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  48.53 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  37.11 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  39.8 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  40.26 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  35.53 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  42.03 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  32.94 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  35.38 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>