17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5943 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  213  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  57.58 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  40.59 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  43.42 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  45.59 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  42.03 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  43.42 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  38.3 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  43.53 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  39.68 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  37.1 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  36.25 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  40.32 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  35.38 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>