15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1163 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  233  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  48.1 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  56.92 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  44.23 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  53.97 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  42.47 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  38.78 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  46.27 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  32.94 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  40.51 
 
 
107 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  43.04 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13490  hypothetical protein  36.49 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.941148  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  36.14 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>