19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4540 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  47.01 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  41.9 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  47.95 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  37.27 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  35.14 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  37.63 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  37.63 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  37.63 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  37.11 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  41.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  40.23 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  37.23 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  38.04 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>