20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3947 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  265  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  89.31 
 
 
145 aa  237  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  82.81 
 
 
138 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  82.81 
 
 
138 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  81.4 
 
 
138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  78.64 
 
 
148 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  66.67 
 
 
147 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  54.65 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  58.23 
 
 
118 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  57.32 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  45.35 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  50.79 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  37.8 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  35.53 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  34.17 
 
 
140 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  40.23 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  37.84 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  31.08 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>