20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2178 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  276  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  276  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  98.55 
 
 
138 aa  271  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  82.81 
 
 
132 aa  201  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  82.91 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  69.12 
 
 
148 aa  176  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  72.22 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  54.65 
 
 
107 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  57.83 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  59.26 
 
 
106 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  43.4 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  51.52 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  37.63 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  34.78 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  34.57 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  39.39 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  34.21 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  39.73 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  34.58 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>