28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1497 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  62 
 
 
107 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  65.67 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  59.26 
 
 
138 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  59.26 
 
 
138 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  59.26 
 
 
138 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  52.94 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  57.32 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  58.02 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  54.55 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  51.25 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  46.74 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  39.29 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  36.94 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  41.9 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  33.96 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  39.02 
 
 
143 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  36.11 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  38.75 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  41.1 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  37.1 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  40.32 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  34.78 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  33.87 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  31.58 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  34.92 
 
 
167 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>