21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12723 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  100 
 
 
148 aa  296  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  70.59 
 
 
138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  70.59 
 
 
138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  70.59 
 
 
138 aa  179  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  69.77 
 
 
132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  68.99 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  68.06 
 
 
147 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  56.96 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  47.78 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  51.25 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  48.48 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  40.24 
 
 
113 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  39.47 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  39 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  40.79 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  37.23 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  33.65 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  36.92 
 
 
144 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  31.48 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>