29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1871 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  64.03 
 
 
143 aa  184  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  47.06 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  40.59 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  37 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  39.24 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  39.68 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  35.06 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  41.59 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  41.79 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  29.01 
 
 
155 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  36 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  41.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  33.08 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  31.71 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  44.62 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13490  hypothetical protein  34.81 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.941148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  42.03 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  38.71 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  36.92 
 
 
148 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  35.37 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  31.08 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>