20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2905 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  48.28 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  53.97 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  36.84 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  39.77 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  45.07 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  39.71 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  40.45 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  39.68 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  43.42 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  48.33 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  38.37 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  47.17 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  38.16 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  41.1 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>