25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1146 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  39.36 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  37.84 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  35.06 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  44.93 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  39.47 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  35.53 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  32.88 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  40.79 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  36.11 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  34.21 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  41.56 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  31.67 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  34.21 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  34.21 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  34.21 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  35.9 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  35.53 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  32.04 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  29.23 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  34.72 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>