23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2323 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  209  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  48.05 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  48.28 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  53.62 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  43.94 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  37 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  50.79 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  36.45 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  42.39 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  44.93 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  40.3 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  33 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  40.58 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  43.48 
 
 
167 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  41.07 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13490  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.941148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  36.25 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  38.71 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>