23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2298 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  51.22 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  49.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  46.43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  43.53 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  43.28 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  37.66 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  38.37 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  39.02 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  34.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13490  hypothetical protein  34.78 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.941148  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  28.68 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  38.24 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  37.31 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  35.82 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  36.76 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  36.84 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  28.4 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  40.62 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>