21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1945 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  57.58 
 
 		 103 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  45.1 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  43.81 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  51.22 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  45.95 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  48 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  45.59 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  44.62 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  46.27 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  36.23 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  35.94 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  35.82 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  35.94 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13490  hypothetical protein  32.08 
 
 		 132 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.941148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  33.01 
 
 		 147 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0690732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>