24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0281 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  311  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  69.94 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  40.69 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  36.75 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  34.52 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  32.48 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  34 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  37.61 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  32 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  30.41 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  31.54 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  31.58 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  29.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  26.58 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  33.01 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  30.94 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  30.94 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  32.86 
 
 		 174 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  30.94 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  29.45 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>