22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0276 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  309  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  44.3 
 
 
162 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  46.41 
 
 
166 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  41.21 
 
 
169 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  44.37 
 
 
166 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  40.41 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  42.28 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  38.89 
 
 
160 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  39.22 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  37.5 
 
 
176 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  37.76 
 
 
169 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  37.76 
 
 
169 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  37.76 
 
 
169 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  36.11 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  35.53 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  35.14 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  30.57 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  31.58 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  30.32 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>