25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3538 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  327  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  72.19 
 
 
169 aa  238  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  71.7 
 
 
162 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  64.56 
 
 
166 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  60.87 
 
 
166 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  46.41 
 
 
161 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  42.38 
 
 
164 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  42.07 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  39.63 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  36.14 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  35.42 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  35.42 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  35.42 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  36.99 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  33.79 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  36.08 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  27.85 
 
 
184 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  34.86 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  28.14 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  38.1 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  28.39 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>