21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0533 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  319  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  60.26 
 
 
160 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  61.54 
 
 
176 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  53.66 
 
 
173 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  52.76 
 
 
169 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  52.76 
 
 
169 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  52.76 
 
 
169 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  51.19 
 
 
179 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  51.25 
 
 
174 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  147  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  46.84 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  42.38 
 
 
166 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  41.83 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  38.36 
 
 
169 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  39.61 
 
 
166 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  39.24 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  40.41 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  33.73 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  33.02 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>