22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0170 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  347  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  69.43 
 
 		 160 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  61.54 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  53.93 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  54.97 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  59.35 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  57.42 
 
 		 174 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  53.37 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  53.37 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  53.37 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  46.67 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  42.76 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  40.62 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  41.51 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  38.16 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  32.26 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  32.03 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  26.97 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  30.57 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>