18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0309 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  343  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  60.57 
 
 
173 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  61.36 
 
 
174 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  60.23 
 
 
174 aa  210  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  63.12 
 
 
169 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  63.12 
 
 
169 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  63.12 
 
 
169 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  59.01 
 
 
172 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  56.6 
 
 
160 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  52.98 
 
 
164 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  55.06 
 
 
176 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  39.49 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  38.1 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  34.73 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  37.34 
 
 
166 aa  87.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  40.49 
 
 
166 aa  84.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>