26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9321 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  325  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  72.19 
 
 
166 aa  238  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  65.27 
 
 
162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  57.83 
 
 
166 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  56.63 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  41.21 
 
 
161 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  38.36 
 
 
164 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  37.74 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  40.25 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  35.54 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  33.12 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  33.12 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  30.82 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  30.82 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  30.82 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  32.92 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  31.65 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  33.12 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  30.72 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  28.21 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  30.54 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  30.13 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  26.11 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>