13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0229 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  90.86 
 
 
174 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  52.81 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  35.59 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  33.91 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  35.03 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  35.06 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  36.63 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  35.87 
 
 
181 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  30.54 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>