14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0201 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  90.86 
 
 
175 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  51.15 
 
 
166 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  37.79 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  35.8 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  34.1 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  35.26 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  34.09 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  35.67 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  35.52 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  30.72 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  32.48 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  39.19 
 
 
145 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  28.14 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>