17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2019 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  362  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  41.45 
 
 
161 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  37.79 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  38.92 
 
 
164 aa  97.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  35.5 
 
 
163 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  33.73 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  40.69 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  35.1 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  35.19 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  36.14 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  34.3 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  27.85 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  26.06 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  30.39 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  26.11 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>