20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4830 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  310  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  46.95 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  41.88 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  42.41 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  33.73 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  37.27 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  35.12 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  34.09 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  35.03 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  36.75 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  36.8 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  33.02 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  32.09 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  34.86 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  29.19 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  33.04 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  29.81 
 
 
166 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  36.7 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>