23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4049 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  333  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  59.01 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  50.58 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  50.58 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  50.58 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  52.17 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  50.86 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  49.71 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  49.06 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  46.84 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  46.67 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  38.61 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  36.42 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  34.91 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  39.22 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  31.21 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  28.77 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  29.19 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  26.06 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  31.41 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>