24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9320 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  317  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  70.78 
 
 
158 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  41.36 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  41.88 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  35.5 
 
 
184 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  35.26 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  38.61 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  36.77 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  35.06 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  32.53 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  32.7 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  34.21 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  35.93 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  31.65 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  31.21 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  30.32 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  33.77 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  27.81 
 
 
162 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  34.29 
 
 
166 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  28.95 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  39.05 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  39.05 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  39.05 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>