24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  310  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  69.43 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  60.26 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  63.23 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  61.01 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  61.01 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  61.01 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  58.97 
 
 		 174 aa  163  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  60.26 
 
 		 174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  55.35 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  49.06 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  42.07 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  42.76 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  39.22 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  37.74 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  40.13 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  33.73 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  34.12 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  34.21 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  36.42 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  34 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  32.08 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  43.4 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>