85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1820 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1820  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12488  hypothetical protein  46.67 
 
 
268 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2251  hypothetical protein  37.02 
 
 
408 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452898  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1809  hypothetical protein  31.35 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00108479  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  25.89 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  25.33 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0532  hypothetical protein  28.51 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1548  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  26.27 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3371  protein of unknown function DUF980  28.5 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  27.51 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  31.22 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4583  protein of unknown function DUF980  26.11 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24438  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  26.55 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  24.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  25.53 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  22.62 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  25.89 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  22.12 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  24.23 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  26.94 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  25.45 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  25.69 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3321  hypothetical protein  23.44 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701364  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  24.44 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  24.34 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  26.11 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  24.44 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  22.61 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  26.72 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  25.12 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1447  protein of unknown function DUF980  27.19 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  29.55 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1439  hypothetical protein  26.23 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0827394  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  24.6 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  25.21 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  25.21 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  25.21 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  25.21 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  24.6 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  22.48 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  24.19 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  21.31 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  20 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  23.79 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  24.79 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  24.79 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  24.79 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  24.79 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  24.79 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  22.98 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  22.98 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  27.22 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  23.11 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  23.33 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  20.78 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  23.56 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  22.22 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  22.8 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  25.97 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  19.35 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  22.52 
 
 
253 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  24.21 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  22.08 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  20 
 
 
271 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  21.78 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  21.65 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  23.6 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  23.24 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  20.45 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000683564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  23.56 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  23.11 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  25.43 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  22.51 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  24 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  22.97 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  21.4 
 
 
264 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2303  hypothetical protein  20 
 
 
265 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000109705  hitchhiker  7.98783e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  20 
 
 
265 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  20 
 
 
265 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  20 
 
 
265 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>