86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1439 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  533  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0827394  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3321  hypothetical protein  55.7 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  27.16 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12488  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  27.47 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  27.07 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1809  hypothetical protein  29.33 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00108479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  26.2 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  27.83 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  28.02 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  24.73 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  24.82 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  25.97 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  25.82 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  25.82 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  25.82 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  25.82 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  26.84 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2251  hypothetical protein  26.73 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  26.58 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  25.88 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  24.58 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  25.97 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3371  protein of unknown function DUF980  26.09 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1820  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144869  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  24.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  23.61 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  25.65 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0532  hypothetical protein  21.6 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  25.88 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  27.52 
 
 		 304 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4583  protein of unknown function DUF980  26.07 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1548  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  24.03 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  25.86 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  25.73 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  23.25 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  26.39 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  23.89 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2259  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000106573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2819  Mlc titration factor MtfA  23.14 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000714473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1148  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113311  hitchhiker  0.0000000000000428732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0993  Mlc titration factor MtfA  23.14 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000614673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1676  protein of unknown function DUF980  23.14 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0614873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01890  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2099  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.8651900000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01880  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000716342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1670  hypothetical protein  23.14 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  normal  0.343591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  26.63 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1587  protein of unknown function DUF980  25.76 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2303  hypothetical protein  22.27 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000109705  hitchhiker  7.98783e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  22.27 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  26.63 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  22.27 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  22.27 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2561  hypothetical protein  22.17 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00550602  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  21.37 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  22.42 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  22.27 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000683564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  27.18 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  22.77 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1479  hypothetical protein  24.35 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  24.26 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  24.09 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2392  hypothetical protein  21.77 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000626056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2490  hypothetical protein  21.77 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  21.3 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  24.76 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  22.52 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2557  protein of unknown function DUF980  23.79 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  21.93 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  24.29 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  21.52 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2458  protein of unknown function DUF980  29.03 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  22.22 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  23.96 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  20.66 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  21.46 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  21.93 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  21.93 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  21.92 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  24.3 
 
 		 271 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>